中國(guó)科研團(tuán)隊(duì)首次完整公布小鼠基因組全部染色體
中新社杭州9月11日電 (林波)西湖大學(xué)遺傳物質(zhì)表達(dá)與重構(gòu)全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室俞曉春團(tuán)隊(duì)11日在國(guó)際學(xué)術(shù)期刊《科學(xué)》(Science)發(fā)表成果:完整的端粒到端粒小鼠Y染色體序列,構(gòu)建了覆蓋小鼠全部染色體的參考序列。
小鼠的基因組與人類高度同源,從疾病機(jī)制解析到新藥研發(fā)驗(yàn)證,從發(fā)育規(guī)律探索到遺傳功能研究,絕大多數(shù)生命科學(xué)問(wèn)題的回答,都要先在小鼠身上尋找線索。因此,小鼠基因組研究的完整程度,直接影響著相關(guān)研究的可靠性與準(zhǔn)確度,Y染色體或許是其中最難整理的一項(xiàng)。
小鼠Y染色體超過(guò)90%的序列由高度重復(fù)單元構(gòu)成,傳統(tǒng)測(cè)序技術(shù)既無(wú)法辨析它們的各自歸屬,也無(wú)法確定其排列順序。同時(shí),Y染色體末端還存在一段偽常染色體區(qū)(PAR),它與X染色體在此處高度同源,在減數(shù)分裂中,X與Y需在此配對(duì)并交換遺傳物質(zhì)。這種極高的相似性,極易導(dǎo)致數(shù)據(jù)“張冠李戴”。
通過(guò)研究,俞曉春團(tuán)隊(duì)最終獲得全長(zhǎng)95.21Mbp(9521萬(wàn)堿基對(duì))的高質(zhì)量Y染色體序列,新增8.70Mbp(870萬(wàn)堿基對(duì))此前未被鑒定的序列,填補(bǔ)了舊版參考基因組中約9%的空白?;谕暾蛄?,團(tuán)隊(duì)新確認(rèn)了120個(gè)蛋白編碼基因,使蛋白編碼基因的總數(shù)上升到273個(gè)。
“這說(shuō)明小鼠Y染色體攜帶的遺傳指令遠(yuǎn)比預(yù)想豐富,為未來(lái)研究雄性生殖與發(fā)育提供了重要線索。”俞曉春說(shuō)。
此外,研究發(fā)現(xiàn),Y染色體的著絲粒區(qū)域缺失了一段在其他染色體上普遍存在的“錨定序列”(CENP-B box),使得Y染色體在細(xì)胞分裂時(shí)與紡錘絲的連接可能不夠穩(wěn)固,從而更容易發(fā)生脫落。這一結(jié)構(gòu)特征,為解釋老年男性血細(xì)胞中常見(jiàn)的“Y染色體丟失”現(xiàn)象提供了直接證據(jù)。
該團(tuán)隊(duì)還繪制了關(guān)鍵區(qū)域(PAR)圖譜,發(fā)現(xiàn)Y染色體在此處擁有11個(gè)獨(dú)特的重復(fù)單元(X染色體僅有3個(gè)),而這些重復(fù)單元的數(shù)量也存在個(gè)體差異;PAR還包含一個(gè)區(qū)域,該區(qū)域富集了與DNA同源重組相關(guān)的特殊基序(GNATNC)。這為理解精子形成過(guò)程中,性染色體如何正確配對(duì)和交換提供了直接依據(jù)。
“我們真正感興趣的,從來(lái)不是‘完成基因組’,而是那些高度重復(fù)序列本身?!庇釙源罕硎?,未來(lái)團(tuán)隊(duì)計(jì)劃繼續(xù)把目光投向那些重復(fù)序列,深入解析其與疾病的相關(guān)性。(完)
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